O Projecto Base da ETAR da Companheira, desenvolvido no âmbito de uma empreitada de concepção construção, contemplou um processo de tratamento da fase líquida constituído por: obra de entrada dotada de gradagem grossa, gradagem fina, desarenação e desengorduramento, compactação de gradados, classificação de areias, e concentração de gorduras; equipamento para recepção, gradagem, armazenamento e bombagem de trasfega dos efluentes de fossas sépticas para o tratamento preliminar; estação elevatória inicial; tanque de lamas activadas em arejamento por baixa carga; decantador secundário; tratamento terciário constituído por: microtamisação e desinfecção por ultravioleta em canal; medição e descarga no meio receptor.

Para a reutilização de água residual tratada para serviço na ETAR, a ETAR integrou ainda um reservatório de armazenamento de água residual tratada, filtros metálicos e desinfecção por ultravioleta em reactor fechado.

No que se refere à fase sólida, o esquema de tratamento integrou os seguintes órgãos: armazenamento das lamas a espessar; flotadores; armazenamento das lamas a desidratar; centrifuga para desidratação mecânica de lamas e silo de armazenamento para lamas desidratadas.

A ETAR da Companheira foi dimensionada para servir no ano de horizonte de projecto 200000 hab.equi.