El problema ambiental del proyecto LIFE Águeda (conservación y manejo de peces migratorios en la cuenca hidrográfica de Vouga) son los cambios hidromorfológicos en los cursos de agua, que hacen imposible la migración de peces de este hábitat. El estado ecológico es desfavorable en el sentido de la Directiva Marco del Agua (DMA). Teniendo en cuenta la intervención de la DMA, el proyecto apunta a superar los siguientes problemas:

• discontinuidad longitudinal del río Águeda y Alfusqueiro, que garantiza la renaturalización del hábitat y la recreación, y un estado ecológico favorable a la DMA, para poblaciones de peces migratorios como la anguila europea (Anguilla anguila), allis shad (Alosa alosa), twaite shad (Alosa fallax) y la lamprea marina (Petromyzon marinus), que representan importantes recursos pesqueros. Este enfoque beneficiará la conservación de otra especie endémica de Portugal, con una distribución restringida a las cuencas de Vouga y Esmoriz (Costa de Prata Lamprey, Lampetra alavariensis).
• incapacidad de la planta hidroeléctrica de Grela (en el río Vouga), a través de la translocación de anguilas juveniles europeas (Anguilla anguilla) y su posterior liberación en secciones restauradas de los ríos Águeda y Alfusqueiro, contribuyendo al Plan de Manejo de la Anguila Europea (Reglamento (CE) No 1100/2007 - que establece medidas para la recuperación de su stock).